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Twist Bioscience公司推出的FlexPrep? 超高通量文庫制備試劑盒,通過(guò)引入新穎的 Normalization by Ligation ? (NBL) 技術(shù),改進(jìn)標準酶促片段化文庫制備方法,以低成本實(shí)現高通量,旨在加速芯片用戶(hù)在群體基因組學(xué)和農業(yè)基因組學(xué)領(lǐng)域的NGS研究。
Twist FlexPrep? 超高通量(UHT)文庫制備試劑盒
Twist FlexPrep ? 超高通量(UHT)文庫制備試劑盒的工作流程旨在為簡(jiǎn)化和大規模擴展 Twist 已建立的酶切方法而設計。Normalization by Ligation ? (NBL) 技術(shù)消除了在文庫制備前對每個(gè)DNA樣本進(jìn)行定量和對大量人工耗費的需要,從而大大節省了每個(gè)樣本的成本。在多孔板中對每個(gè)樣本進(jìn)行片段化和接頭連接后,*多可以將12個(gè)樣本合并到一個(gè)管中,顯著(zhù)減少后續磁珠純化和擴增步驟所需的試劑用量和成本??衫么嗽噭┖兄苽涞奈膸?,使用靶向富集組合進(jìn)行全基因組或靶向測序。所有多孔板和管式都經(jīng)過(guò)優(yōu)化,以確保與關(guān)鍵自動(dòng)化系統兼容,這對于希望簡(jiǎn)化工作流程并減少動(dòng)手時(shí)間的實(shí)驗室來(lái)說(shuō)是一個(gè)關(guān)鍵考慮因素。
關(guān)鍵優(yōu)勢
集成的NBL技術(shù)
? 消除前期歸一化處理
? 無(wú)需中間定量
? 樣品起始量區間寬泛(30ng-300ng)
早期混樣節省成本
? 接頭連接反應之后將96個(gè)樣本合并到8管中
? 降低上游反應體積
? 減少下游反應耗材
專(zhuān)為超高容量多重測序而生
? 單個(gè)試劑盒多達1152個(gè)UDIs
? 反應數量擴大12倍
? 每個(gè)靶向富集反應可支持96個(gè)樣本
數據展示
消除前期歸一化和中間定量樣品
Twist FlexPrep UHT文庫制備試劑盒采用新穎的 Normalization by Ligation(NBL)技術(shù),消除了前期和中間樣品定量的需要,簡(jiǎn)化了測序工作流程(圖1)。
專(zhuān)為節省成本且不影響質(zhì)量而構建的工作流程
FlexPrep標準化接頭包含12個(gè)內聯(lián)條形碼,它允許超高通量和自動(dòng)化友好的多重測序策略(圖2)。
Twist FlexPrep UHT文庫制備試劑盒,通過(guò)在一個(gè)試劑盒的單次測序中運行多達1152個(gè)樣本來(lái)實(shí)現測序通量*大化,這種提高效率的策略可以轉化為節省試劑、耗材和時(shí)間成本。與單獨處理樣本相比,FlexPrep?將使用的耗材減少了12倍,并將移液器吸頭的數量從標準試劑盒中使用的17,000多個(gè)減少到FlexPrep? UHT試劑盒中使用的不到4,000個(gè)。
Twist FlexPrep UHT產(chǎn)量均一,且插入片段尺寸穩定
Twist FlexPrep UHT Library Preparation Kit支持30 ng至300 ng的起始量范圍,對全基因組測序(WGS)或靶向富集(TE)的均勻性和插入片段尺寸的影響*?。ㄈ鐖D3和圖4)。
通過(guò)靶向富集確定感興趣區域
FlexPrep的工作流程也可以擴展到靶向富集,其中單個(gè)富集反應可用于多達96個(gè)樣品。
與其他Twist文庫制備試劑盒一樣,FlexPrep UHT生成的高復雜性文庫在靶向富集后具有均勻的覆蓋率(表1)。結合Twsit定制Panel,以實(shí)現對感興趣的基因組區域的可調控且均勻的覆蓋。