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    玩轉環(huán)境樣本檢測,專(zhuān)業(yè)方案讓你事半功倍!
    來(lái)源: | 作者:沃小森 | 發(fā)布時(shí)間: 2024-09-05 | 257 次瀏覽 | 分享到:


    你相信嗎?
    無(wú)需潛入深海,無(wú)需深入叢林 僅憑一杯水或一抔土
    便能開(kāi)啟生物多樣性探索的奇妙之旅
    揭秘如江豚等珍稀生物的蹤跡
    這就是環(huán)境DNA技術(shù)的魔力!
    從環(huán)境樣本中提取DNA片段,結合PCR和DNA測序等分子生物學(xué)技術(shù)來(lái)定性或定量檢測目標生物,可以對土壤、水體、空氣等環(huán)境介質(zhì)中的微生物、生物體等進(jìn)行分析。作為新型的環(huán)境研究技術(shù)手段,廣泛應用于生物多樣性研究、環(huán)境監測、動(dòng)物食性分析等多個(gè)領(lǐng)域。
    環(huán)境樣本的核酸提取難點(diǎn)解析
    · 樣本前處理復雜:
    環(huán)境樣本中微生物及其他生物體種類(lèi)繁多,不同生物體的核酸含量、結構等差異較大,使得前處理過(guò)程難以統一。
    · 提取得率不穩定:
    不同微生物或生物體的細胞結構不同,如G+、G-和真菌在細胞壁成分和厚度方面具有明顯差異,裂解不充分可能使核酸提取出現偏好性,加上傳統手工操作導致得率不穩定。
    · 抑制劑多影響下游實(shí)驗:
    環(huán)境樣本中常含有腐殖質(zhì)、色素等雜質(zhì),干擾核酸提取純化和后續的檢測分析。
    · 操作繁雜,通量低:
    傳統的核酸提取方法通常涉及多個(gè)步驟,操作繁瑣,通量低。
    TIANGEN 環(huán)境樣本解決方案
    TIANGEN憑借多年的核酸純化經(jīng)驗,針對環(huán)境樣本提取檢測難題,整合了一套高效的自動(dòng)化解決方案。該方案能輕松應對各類(lèi)環(huán)境樣本,顯著(zhù)提升提取效率和產(chǎn)量。提取出的核酸可直接用于PCR、建庫、測序等分子生物學(xué)實(shí)驗。

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    環(huán)境樣本自動(dòng)化核酸提取產(chǎn)品

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    方案優(yōu)勢

    前處理簡(jiǎn)單

    高通量研磨均質(zhì)儀搭配預分裝研磨珠及成熟的研磨方案,輕松處理各類(lèi)環(huán)境樣本。

    穩定均一

    磁珠法全自動(dòng)化提取,穩定性好,實(shí)驗結果可重復性高,均一性好。

    得率高

    預分裝研磨珠配合高效裂解液,可裂解多種復雜成分,保證微生物多樣性及得率。

    純度高

    獨特的脫腐殖酸緩沖液可有效去除腐殖酸等抑制物,獲得高純度DNA。

    通用性廣

    獨特的樣本破碎與裂解體系,適用于各種樣本。

    環(huán)境樣本PCR檢測儀器及試劑

    TGreat Expert 雙槽梯度PCR儀


    · 一臺頂兩臺,節省空間

    · 超大彩色觸控屏幕,程序設置簡(jiǎn)單

    · 外觀(guān)精美,運行噪音低

    · 性能穩定,控溫準確

    高保真PCR試劑盒


    · 高保真性:為T(mén)aq酶的180倍

    · 延伸力強:擴增速度5 sec/kb,擴增產(chǎn)物長(cháng)達20 kb

    · 高靈敏度:基因組模板用量低至1 ng

    · 操作簡(jiǎn)便:只需加入模板和引物,輕松配體系

    環(huán)境樣本檢測文庫構建產(chǎn)品

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    實(shí)驗案例

    有效提取多種環(huán)境樣本基因組DNA

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    使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)分別提取各類(lèi)樣本的基因組DNA,TIANGEN提取結果超過(guò)或達到競品相當水平。


    16S區域可有效檢出

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    將使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)提取小鼠糞便、竹林土+紅茶粉樣本得到的微生物基因組DNA,用細菌16S引物(V3-V4)進(jìn)行PCR檢測,電泳結果顯示,DP613與競品提取的核酸進(jìn)行16S擴增均可有效檢出。

    ITS區域可有效檢出

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    將使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)提取池塘淤泥、 竹林土+紅茶粉樣本得到的微生物基因組DNA,擴增ITS區域(ITS1)進(jìn)行PCR檢測。電泳結果顯示,DP613與競品提取的核酸進(jìn)行ITS擴增均可有效檢出。

    抑制物殘留低,可進(jìn)行后續實(shí)驗

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    使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613和競品(國際知名品牌A、B)提取的核酸原液作為PCR的抑制物,加入到qPCR體系中檢測已知濃度的質(zhì)粒,判斷提取產(chǎn)物對PCR實(shí)驗的抑制性。結果表明,DP613提取的核酸,PCR的抑制物與競品B相當且優(yōu)于競品A,幾乎不影響定量PCR反應。

    適用于微生物群落分

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    使用TGuide S16核酸提取純化儀搭配DP613、競品(國際知名品牌A、B)提取微生物群落標準品(標準品-D6300)基 因組DNA,然后進(jìn)行16S測序,分析各菌屬水平檢測的Tags比例。每個(gè)試劑盒進(jìn)行兩次平行實(shí)驗。結論:DP613提取 的微生物基因組DNA,8個(gè)細菌微生物均被檢出,與標準品的混合比例類(lèi)似。

    可有效檢出環(huán)境樣本中的生物體

    圖片圖片

    采集2L池塘水(模擬檢測樣本),分別從上下游的兩個(gè)地點(diǎn)取樣,上游樣本編號1和2、下游樣本編號3和4,使用自動(dòng)化核酸提取純化儀搭配TGuide Smart環(huán)境微生物基因組DNA提取試劑盒(DP613)提取樣本中的DNA,并通過(guò)PCR擴增對魚(yú)類(lèi)與底棲類(lèi)生物進(jìn)行定性檢測,電泳結果顯示可有效檢出。



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